Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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HDAC6Q9UBN7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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