Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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