Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms