Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5DQ9BY66 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms