Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC32.64■■■□□ 2.82
FANCD2Q9BXW9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
FANCD2Q9BXW9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
FANCD2Q9BXW9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
FANCD2Q9BXW9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
FANCD2Q9BXW9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
FANCD2Q9BXW9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms