Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRIP1Q9BX63 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms