Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UHRF1Q96T88 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UHRF1Q96T88 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UHRF1Q96T88 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UHRF1Q96T88 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UHRF1Q96T88 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UHRF1Q96T88 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UHRF1Q96T88 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UHRF1Q96T88 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UHRF1Q96T88 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UHRF1Q96T88 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UHRF1Q96T88 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UHRF1Q96T88 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UHRF1Q96T88 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UHRF1Q96T88 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UHRF1Q96T88 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UHRF1Q96T88 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UHRF1Q96T88 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UHRF1Q96T88 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UHRF1Q96T88 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UHRF1Q96T88 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UHRF1Q96T88 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UHRF1Q96T88 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UHRF1Q96T88 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UHRF1Q96T88 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UHRF1Q96T88 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UHRF1Q96T88 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UHRF1Q96T88 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms