Protein–RNA interactions for Protein: Q96S21

RAB40C, Ras-related protein Rab-40C, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40CQ96S21 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40CQ96S21 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms