Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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