Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN4Q96Q06 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms