Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms