Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EP400Q96L91 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms