Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms