Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms