Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A3Q93084 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms