Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHIPQ8WWQ0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms