Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms