Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD1Q8TEB9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD1Q8TEB9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD1Q8TEB9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD1Q8TEB9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD1Q8TEB9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD1Q8TEB9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD1Q8TEB9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD1Q8TEB9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD1Q8TEB9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD1Q8TEB9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms