Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms