Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NME9Q86XW9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms