Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms