Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM5Q71RC9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms