Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms