Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSAPQ6IQ19 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms