Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms