Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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KRTAP21-3Q3LHN1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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KRTAP21-3Q3LHN1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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KRTAP21-3Q3LHN1 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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KRTAP21-3Q3LHN1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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