Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms