Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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TNXAQ16473 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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TNXAQ16473 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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