Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms