Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
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