Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
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