Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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