Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
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GTF3C1Q12789 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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GTF3C1Q12789 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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GTF3C1Q12789 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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GTF3C1Q12789 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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GTF3C1Q12789 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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GTF3C1Q12789 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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GTF3C1Q12789 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
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