Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms