Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL16A1Q07092 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL16A1Q07092 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL16A1Q07092 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL16A1Q07092 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL16A1Q07092 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL16A1Q07092 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL16A1Q07092 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL16A1Q07092 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL16A1Q07092 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
COL16A1Q07092 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL16A1Q07092 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL16A1Q07092 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL16A1Q07092 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL16A1Q07092 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL16A1Q07092 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL16A1Q07092 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL16A1Q07092 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms