Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms