Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms