Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms