Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms