Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms