Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1BQ00975 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms