Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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FAM3AP98173 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
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