Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEFSECP57772 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms