Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATN1P54259 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATN1P54259 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATN1P54259 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATN1P54259 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATN1P54259 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATN1P54259 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATN1P54259 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATN1P54259 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATN1P54259 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATN1P54259 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATN1P54259 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATN1P54259 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATN1P54259 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATN1P54259 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATN1P54259 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATN1P54259 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATN1P54259 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATN1P54259 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATN1P54259 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATN1P54259 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATN1P54259 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATN1P54259 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATN1P54259 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATN1P54259 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATN1P54259 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATN1P54259 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATN1P54259 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATN1P54259 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATN1P54259 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATN1P54259 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATN1P54259 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATN1P54259 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATN1P54259 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATN1P54259 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATN1P54259 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATN1P54259 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATN1P54259 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATN1P54259 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATN1P54259 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATN1P54259 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATN1P54259 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATN1P54259 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATN1P54259 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATN1P54259 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATN1P54259 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATN1P54259 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATN1P54259 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATN1P54259 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATN1P54259 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATN1P54259 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATN1P54259 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATN1P54259 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATN1P54259 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATN1P54259 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATN1P54259 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATN1P54259 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATN1P54259 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATN1P54259 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATN1P54259 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATN1P54259 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATN1P54259 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATN1P54259 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATN1P54259 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATN1P54259 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATN1P54259 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATN1P54259 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATN1P54259 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATN1P54259 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATN1P54259 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATN1P54259 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATN1P54259 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATN1P54259 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATN1P54259 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATN1P54259 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATN1P54259 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATN1P54259 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATN1P54259 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATN1P54259 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATN1P54259 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATN1P54259 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATN1P54259 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATN1P54259 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATN1P54259 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATN1P54259 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATN1P54259 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATN1P54259 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATN1P54259 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATN1P54259 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATN1P54259 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATN1P54259 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATN1P54259 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATN1P54259 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATN1P54259 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATN1P54259 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATN1P54259 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATN1P54259 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATN1P54259 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATN1P54259 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATN1P54259 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms