Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms