Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA8P48165 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA8P48165 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA8P48165 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA8P48165 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA8P48165 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA8P48165 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA8P48165 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA8P48165 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA8P48165 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA8P48165 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA8P48165 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA8P48165 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA8P48165 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA8P48165 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA8P48165 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA8P48165 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA8P48165 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA8P48165 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA8P48165 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA8P48165 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA8P48165 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA8P48165 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA8P48165 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA8P48165 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA8P48165 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA8P48165 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA8P48165 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA8P48165 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA8P48165 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA8P48165 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA8P48165 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA8P48165 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA8P48165 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA8P48165 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA8P48165 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA8P48165 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA8P48165 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA8P48165 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA8P48165 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA8P48165 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA8P48165 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA8P48165 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA8P48165 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA8P48165 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA8P48165 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA8P48165 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA8P48165 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA8P48165 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA8P48165 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA8P48165 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA8P48165 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA8P48165 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA8P48165 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA8P48165 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA8P48165 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA8P48165 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA8P48165 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA8P48165 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA8P48165 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA8P48165 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA8P48165 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA8P48165 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA8P48165 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA8P48165 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA8P48165 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA8P48165 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA8P48165 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA8P48165 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA8P48165 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA8P48165 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA8P48165 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA8P48165 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA8P48165 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA8P48165 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA8P48165 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA8P48165 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA8P48165 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA8P48165 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA8P48165 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA8P48165 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA8P48165 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA8P48165 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA8P48165 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA8P48165 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA8P48165 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA8P48165 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA8P48165 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA8P48165 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA8P48165 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA8P48165 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA8P48165 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA8P48165 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA8P48165 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA8P48165 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA8P48165 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA8P48165 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA8P48165 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA8P48165 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA8P48165 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms