Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms