Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms