Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TRHP20396 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TRHP20396 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRHP20396 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRHP20396 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRHP20396 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRHP20396 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRHP20396 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRHP20396 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRHP20396 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRHP20396 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRHP20396 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRHP20396 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRHP20396 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRHP20396 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRHP20396 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRHP20396 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TRHP20396 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TRHP20396 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRHP20396 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRHP20396 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRHP20396 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRHP20396 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRHP20396 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRHP20396 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRHP20396 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRHP20396 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRHP20396 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRHP20396 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRHP20396 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRHP20396 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRHP20396 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRHP20396 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRHP20396 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRHP20396 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRHP20396 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TRHP20396 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRHP20396 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRHP20396 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TRHP20396 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TRHP20396 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRHP20396 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRHP20396 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRHP20396 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRHP20396 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRHP20396 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRHP20396 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRHP20396 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRHP20396 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRHP20396 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRHP20396 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRHP20396 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRHP20396 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRHP20396 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRHP20396 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRHP20396 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRHP20396 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRHP20396 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRHP20396 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRHP20396 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TRHP20396 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TRHP20396 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRHP20396 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TRHP20396 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRHP20396 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRHP20396 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRHP20396 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRHP20396 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRHP20396 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRHP20396 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRHP20396 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRHP20396 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TRHP20396 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRHP20396 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRHP20396 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRHP20396 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRHP20396 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRHP20396 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRHP20396 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRHP20396 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRHP20396 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRHP20396 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TRHP20396 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRHP20396 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRHP20396 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TRHP20396 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRHP20396 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRHP20396 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRHP20396 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRHP20396 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRHP20396 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TRHP20396 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRHP20396 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRHP20396 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRHP20396 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRHP20396 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TRHP20396 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRHP20396 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRHP20396 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TRHP20396 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms