Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms